97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0138 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  330  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  57.43 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  50.91 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  54.04 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  51.03 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  43.84 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  44.79 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  42.31 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  42.04 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  39.46 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  38.85 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  45.52 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  40.99 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  37.41 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  40.24 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  33.94 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  35.95 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  29.3 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.42 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  39.13 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  33.54 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  44.52 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  33.09 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  34.91 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  35.2 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  30.86 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.43 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  38.35 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.11 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  36.15 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  35.95 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  32.16 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.15 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  33.68 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  37.76 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  28.57 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.51 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.82 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.12 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  30.46 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.29 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1374  hypothetical protein  30.93 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.82 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  28.68 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.73 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  34.35 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  30.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.65 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  34.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.1 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  34.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.29 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  43.94 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  35.14 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  32.17 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.28 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  28.24 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  37.17 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  33.63 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  35.19 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  34.51 
 
 		 166 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.14 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  32.29 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  34.09 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  30.7 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>