194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0738 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  51.56 
 
 
170 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  56.92 
 
 
135 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  46.21 
 
 
135 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  45.45 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  46.21 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  46.21 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  47.93 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  51.85 
 
 
135 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  52.59 
 
 
135 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  51.11 
 
 
134 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  52.59 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  51.13 
 
 
135 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  51.13 
 
 
135 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  51.13 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  48.76 
 
 
121 aa  106  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  48.76 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  46.67 
 
 
137 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  49.59 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  44.85 
 
 
147 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  51.85 
 
 
135 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  46.67 
 
 
137 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  50.78 
 
 
134 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  45.45 
 
 
134 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  45.45 
 
 
134 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  45.93 
 
 
137 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  46.97 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  48.44 
 
 
134 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  46.97 
 
 
134 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  50.75 
 
 
141 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  49.62 
 
 
135 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  45.59 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  47.01 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  42.15 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  41.22 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  48.48 
 
 
134 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0174781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  42.24 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  41.32 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  48.12 
 
 
138 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  38.02 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.21 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  45.76 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  50.37 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  45.74 
 
 
132 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  38.76 
 
 
174 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  40.98 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  38.35 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  44.63 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  45.93 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  40.32 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  38.58 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.37 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  40.16 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  38.53 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  42.11 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  42.86 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.28 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  32.5 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  36.29 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  35.45 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  37.69 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.85 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.3 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  29.51 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  36.79 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  34.92 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  36.23 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.06 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.19 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  37.59 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  37.59 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.58 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  32.35 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.45 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  37.39 
 
 
170 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>