99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2430 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  58.78 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  60.12 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  57.23 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  53.46 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  52.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  47.97 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  55.8 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  44.79 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  60.71 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  41.61 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  40.88 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  37.95 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  43.61 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  36.05 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.53 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  38.19 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  35.67 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  31.21 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  36.07 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  35.4 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  39.23 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.01 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  32.93 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  37.8 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  42.11 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  24.46 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  32.46 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  40.54 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  40.54 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  40.44 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40.54 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  38.26 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  34.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  38.58 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  41 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  31.68 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  39.83 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  43.36 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.38 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.55 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  31.93 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  31.09 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.82 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  36.96 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.69 
 
 		 133 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.37 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  40.86 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  40.58 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.02 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  37.38 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.05 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  37.59 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.39 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.63 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.82 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  35.09 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.17 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  27.66 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  32.76 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  34.88 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.97 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  30.6 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  29.2 
 
 		 125 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  38.89 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  41.03 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  33.66 
 
 		 133 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  35.34 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  28.8 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>