199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2996 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  47.2 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  37.76 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.35 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40.16 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  38.24 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  40.18 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  40.18 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  37.14 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  37.14 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  36.15 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.38 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  40.52 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  37.17 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  36.28 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  36.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  37.1 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  36.92 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  33.81 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  38.94 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.12 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.6 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  36.57 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  36.57 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  36.57 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.11 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  36.67 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.06 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.06 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  35.85 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  40.35 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  39.6 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  34.29 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0973  hypothetical protein  34.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0109985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.62 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.82 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  36.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  40.17 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.26 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  37 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.43 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.38 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  35.24 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.63 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  34.23 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.43 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  35.38 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  34.82 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  34.15 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  37.38 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  37.38 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  34.45 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  35.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.03 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.56 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  39.25 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.64 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  31.97 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  36.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  36.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  33.85 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>