53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0522 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  45.75 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  50.68 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  37.86 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  37.71 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  33.99 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  39.13 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  43.33 
 
 
161 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  35.57 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  34.87 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  38.52 
 
 
165 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  48.87 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  37.06 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  41.03 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  44.04 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  34.75 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  37.93 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  36.17 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.71 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  34.27 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  38.51 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  35.2 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.71 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  38.07 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  30.68 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  35.4 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  39.66 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  31.48 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  30.64 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  32.32 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  28.03 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  36.46 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.56 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  31.16 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.4 
 
 
149 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  31.09 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.11 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  36.04 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.04 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  40.32 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  31.03 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  30.37 
 
 
149 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  47.83 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  29.66 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>