106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2753 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  330  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  49.4 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  52.45 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  48.89 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  44.03 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  39.01 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  39.88 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  43.45 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  41.07 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  41.3 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  42.31 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  38.19 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  41.46 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  35.26 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.91 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  41.3 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  40.99 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  38.35 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  42.96 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  44.06 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  38.33 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  31.79 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  39.42 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  34.31 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.8 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  36.59 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  36.23 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.3 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  41.74 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.61 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  39.47 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.21 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  31.41 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.19 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.54 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  33.88 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.54 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  37.42 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  41.48 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  38.26 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.41 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  30.82 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  34.31 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  42.11 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  31.91 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  35.11 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.95 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  32.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  37.72 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  35.07 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  28.93 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  32.18 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  32.61 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.41 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  27.13 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  40.35 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.34 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  37.38 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  32.62 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  33.93 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  30.82 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  30.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.6 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  31.39 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  36.94 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  30.15 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.11 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  34.81 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  29.71 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  29.75 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  29.93 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  29.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  29.77 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  30.22 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>