157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1323 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  270  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  58.45 
 
 
143 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  54.93 
 
 
142 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  55.94 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  55.32 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  51.45 
 
 
142 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  52.45 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  52.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  57.94 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  52.86 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  52.86 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  57.94 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  52.86 
 
 
146 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  52.86 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  52.86 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  61.59 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  53.52 
 
 
145 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  55.4 
 
 
144 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  53.57 
 
 
157 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  53.57 
 
 
145 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  53.15 
 
 
143 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  53.57 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  50.74 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  54.35 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  48.57 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  48.94 
 
 
144 aa  114  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  53.49 
 
 
142 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  56.12 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  46.04 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  46.43 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  45.77 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  50.45 
 
 
114 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  53.28 
 
 
140 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  37.76 
 
 
139 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.65 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.78 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.6 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  34.4 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.16 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.61 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  37.7 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  37.7 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.35 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  29.01 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.43 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  31.65 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  31.16 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  32.39 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  35.48 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  33.57 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  28.36 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  42.53 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  28.57 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  32.09 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  38.74 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.04 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35.65 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.97 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  30.3 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  36.59 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  28.24 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  33.08 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  33.08 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  26.92 
 
 
138 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  36.94 
 
 
134 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  37.84 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.8 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  38.74 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.63 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  36.11 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  41.35 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.04 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  32.74 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  33.58 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  36.94 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  36.94 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  36.94 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  33.04 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  32.11 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  35.45 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  32.85 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>