212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6273 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  91.67 
 
 		 144 aa  271  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  84.03 
 
 		 144 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  84.03 
 
 		 144 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  83.33 
 
 		 144 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  87.5 
 
 		 144 aa  235  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  72.22 
 
 		 144 aa  217  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  74.31 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  67.42 
 
 		 134 aa  183  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  54.62 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  60 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  49.21 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  52.94 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  59.34 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  52.71 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  59.34 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  59.6 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  59.6 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  59.6 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  47.9 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  49.59 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  47.24 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  48.78 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  43.7 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  42.64 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  46.97 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  51.49 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  40.48 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  43.81 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  44.26 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.49 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.89 
 
 		 333 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  40.16 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  50.41 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  36.92 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  43.51 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  40.74 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  40.48 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.38 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  40.48 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  40.46 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.83 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.21 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.09 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  37.3 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  41.07 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  42.97 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  43.22 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  35.07 
 
 		 335 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  39.25 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  39.01 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.12 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.14 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.14 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.01 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.57 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  46.85 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  46.85 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  34.85 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  36.03 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  36.59 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  36.59 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  39.06 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  37.98 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  36.63 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  42.11 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  32.58 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  32.58 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  35.54 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.61 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  35.54 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  37.74 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  31.71 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0942  hypothetical protein  30.13 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000599869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  35.19 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  36.5 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.81 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  36.54 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  32 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.32 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>