223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1323 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  69.18 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  58.46 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  61.34 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  57.52 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  51.09 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  63.48 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  57.82 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  57.82 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.44 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  54.42 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  56.64 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  47.24 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  58.91 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  44.88 
 
 		 163 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  43.7 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  44.83 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  38.41 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  49.5 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  41.01 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  37.9 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  43.51 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  43.51 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  42.06 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  42.75 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  42.42 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  39.83 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  52.38 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  46.85 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.38 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  42.15 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.52 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  37.32 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  39.62 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.39 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  44.14 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  36.29 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.2 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  38.97 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  43.22 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  44.83 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  35.82 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  42.99 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  36.45 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  38.3 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.88 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  35.46 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  40.43 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  35.51 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.16 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  37.82 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  44.86 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  39.09 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  37.04 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  35.38 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  31.4 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.71 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.4 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.11 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  37.82 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  38.71 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  30.28 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  42.35 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.68 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  38.71 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.91 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  38.74 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.3 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  37.12 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.29 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  36.44 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.05 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  38.02 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>