144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2606 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.45 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.71 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  31.54 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.88 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4333  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  28.7 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  30.7 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  29.23 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  31.75 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  30.83 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  30.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  27.64 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.51 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  28.46 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  30 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.03 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  31.58 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  26.47 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  27.73 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  27.5 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  34.58 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  26.56 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  34.26 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  30.94 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5722  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  29.06 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.93 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  28.57 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  29.46 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  30.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.46 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  30.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  30.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  32.32 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  25.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  27.68 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  25.44 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  30.1 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  24.78 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  31.48 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  29.09 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  30.15 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  30.84 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  27.05 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  30.89 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  30.89 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  29.46 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  31.31 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  29.25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  32.53 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  31.01 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  27.19 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  29.6 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  30.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  29.52 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  27.03 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  30.48 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  27.18 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  30.48 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  30.34 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  27.73 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>