152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1803 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 135 aa  264  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  82.22 
 
 		 135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  82.22 
 
 		 135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  82.22 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  81.48 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  80.74 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  79.26 
 
 		 135 aa  200  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  76.12 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  75.37 
 
 		 134 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  77.04 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  63.16 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  63.16 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  60.74 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  65.93 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  61.24 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  61.24 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  67.67 
 
 		 138 aa  153  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  58.65 
 
 		 135 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  57.89 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  58.65 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  63.11 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  63.57 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  62.79 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  66.67 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  59.26 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  58.82 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  59.02 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  61.24 
 
 		 134 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  59.02 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  62.02 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  59.69 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  59.4 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  62.41 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  56.41 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  53.28 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  57.14 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  52.46 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  59.84 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  59.02 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  51.64 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  50.82 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  55.56 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  54.89 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  50.82 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  54.1 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  49.62 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  44.78 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  53.08 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  49 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  41.79 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  43.44 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  41.09 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  40.5 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  38.02 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.82 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  37.01 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.94 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  29.69 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.07 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  34.82 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.25 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  36.61 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.8 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  39.67 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.71 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  37.14 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  36.67 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  31.53 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  29.92 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.27 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.85 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  41.59 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  29.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>