149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7427 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  40.15 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  49.55 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  44.78 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  44.03 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  45.52 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  45.52 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  44.78 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  42.42 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  44.78 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  42.54 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  46.28 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  44.78 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  42.61 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  45.67 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  44.88 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  38.84 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  47.71 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  41.32 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  41.32 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  44.66 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  42.54 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  40.5 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  45.87 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  43.31 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  42.11 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  85.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  42.15 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  45.87 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  42.54 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  42.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  37.88 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.66 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  38.35 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  38.83 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.82 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.75 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38.78 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  34.17 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.5 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.28 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.34 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  33.02 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.54 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  30.65 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.19 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  32.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.19 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  33.04 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  38.68 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  33.85 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  32.17 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  34.09 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.38 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  34.82 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>