139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4296 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  97.95 
 
 		 146 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  95.21 
 
 		 146 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  78.08 
 
 		 146 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  70.63 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  63.64 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  62.94 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  51.75 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  50.35 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  55.8 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  52.86 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  54.17 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  54.17 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  53.47 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  53.9 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  52.45 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  52.45 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  52.86 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  50.78 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  49.65 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  51.05 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  51.39 
 
 		 144 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  46.81 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  44.06 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  46.73 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  37.14 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  45.26 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  42.02 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  42.02 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  39.5 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  40.87 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  40.54 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.94 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  37.14 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.65 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  38.66 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.61 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  28.18 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  29.2 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  28.18 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  28.18 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  32.37 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  41.03 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  34.82 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  34.21 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  37.6 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  31.16 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.72 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  31.86 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  25.36 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.78 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  36.61 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  32.31 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  34.34 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  40 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.08 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  36.54 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  30.97 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  34.69 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  27.13 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.89 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  39.22 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  39.22 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>