157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3070 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  82.96 
 
 
135 aa  213  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  82.96 
 
 
135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  82.96 
 
 
135 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  82.96 
 
 
135 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  81.48 
 
 
135 aa  207  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  80.74 
 
 
141 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  77.61 
 
 
135 aa  202  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  79.26 
 
 
135 aa  200  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  77.78 
 
 
139 aa  199  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  76.12 
 
 
134 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  66.92 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  64.44 
 
 
137 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  66.17 
 
 
137 aa  174  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  68.15 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  69.63 
 
 
135 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  69.92 
 
 
138 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  59.4 
 
 
135 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  60.9 
 
 
134 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  60.9 
 
 
134 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  59.4 
 
 
135 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  62.41 
 
 
134 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  63.11 
 
 
138 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  57.14 
 
 
135 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  57.89 
 
 
146 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  61.65 
 
 
134 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  146  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  63.57 
 
 
134 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  63.03 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  60.9 
 
 
134 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  60.15 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  58.2 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  58.2 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  58.65 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  59.84 
 
 
136 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  60.66 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  58.65 
 
 
143 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  60.15 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  54.92 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  57.89 
 
 
133 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  53.28 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  54.1 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  52.46 
 
 
133 aa  126  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  54.1 
 
 
132 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  57.14 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  55.74 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  53.08 
 
 
135 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  43.51 
 
 
158 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  44.36 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  42.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  41.86 
 
 
170 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  40.37 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  41 
 
 
175 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  36.79 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  34.68 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  39.06 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  37.7 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.31 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.94 
 
 
183 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  40.57 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  40.57 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  38.95 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.02 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  36.92 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.02 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.71 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  34.31 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  43.36 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  43.36 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.38 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  37.82 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  28.99 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>