157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  85.95 
 
 
146 aa  206  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  75.42 
 
 
135 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  80 
 
 
132 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  80 
 
 
132 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  75.42 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  89.09 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  78.18 
 
 
133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  80 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  78.69 
 
 
133 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  73.15 
 
 
138 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  74.51 
 
 
134 aa  164  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  67.23 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  67.23 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  65.83 
 
 
137 aa  157  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  77.05 
 
 
133 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  68.52 
 
 
134 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  68.52 
 
 
134 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  68.57 
 
 
134 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  70 
 
 
141 aa  153  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  68.57 
 
 
134 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  67.27 
 
 
135 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  67.27 
 
 
135 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  66.36 
 
 
135 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  66.39 
 
 
134 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  67.62 
 
 
134 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  67.23 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  69.75 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  60.66 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  60.66 
 
 
137 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  63.64 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  65.45 
 
 
135 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  65.45 
 
 
135 aa  143  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  65 
 
 
134 aa  143  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  61.82 
 
 
139 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  65.45 
 
 
135 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  58.33 
 
 
135 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  62.62 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  63.33 
 
 
135 aa  136  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  59.09 
 
 
135 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  68.52 
 
 
135 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  60.19 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  61.54 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  61.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  58.33 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  63.21 
 
 
138 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  54.21 
 
 
143 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  56.86 
 
 
135 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  49.07 
 
 
136 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  48.51 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  42.11 
 
 
147 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  42.02 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  42.98 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  39.05 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.13 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.78 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.29 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  41.27 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  37.04 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.45 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  41.05 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  45.33 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.55 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  39.09 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.61 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  38.94 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  38.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  33.02 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.96 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  36.97 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  38.24 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.04 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  32.11 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  36.44 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.52 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  42.7 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  37.25 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>