187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2812 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  56.64 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  54.41 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  52.55 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  36.92 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  39.55 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.22 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.34 
 
 		 333 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  39.5 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  38.02 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  35.04 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  34.96 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  38.76 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.07 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35.16 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  37.88 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  36.97 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  40.87 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  39.22 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.3 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  34.68 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  35.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  35.94 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.2 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  37.72 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  37.72 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  35.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.2 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  39.66 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.43 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.79 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.3 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  35.71 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  36.79 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  32.74 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.81 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  38.24 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  35.34 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.88 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  34.71 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.6 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  31.78 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  35.2 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.88 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.58 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  40.19 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.35 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.37 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  34.45 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  37.89 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  40.2 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  29.82 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  26.98 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  32.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.2 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  34.45 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.73 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  32.29 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  35.24 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.24 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  40.82 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>