171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4093 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  87.98 
 
 		 181 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  45.86 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  46.25 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  48.12 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  43.28 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  41.09 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  41.09 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  46.21 
 
 		 166 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.98 
 
 		 135 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.33 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  40.94 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  38.66 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  38.58 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  42.64 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  36.44 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.4 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  41.09 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  38.58 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  38.58 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.06 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  34.19 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  39.6 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  34.19 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.28 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  36.44 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  39.45 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  33.86 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  35.43 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.51 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  33.62 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.85 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  38.95 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.81 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  38.17 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.34 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 		 139 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.09 
 
 		 144 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.72 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.3 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  35.61 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  33.64 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  35.59 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.07 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  37.21 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.69 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  38.94 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  38.94 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  38.94 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  29.08 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  32.32 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.4 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  33.94 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  31.06 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  29.55 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  39.05 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.74 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  35.43 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  39.62 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  30.91 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  33.93 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  38.81 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  34.51 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  39.1 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  33.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  36.22 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  33.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  33.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  33.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>