212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7748 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
133 aa  258  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  56.2 
 
 
134 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  51.54 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  51.54 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  51.54 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  51.54 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  56.76 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  46.4 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  52.71 
 
 
137 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  54.29 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  48.09 
 
 
143 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  49.11 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  45.74 
 
 
139 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  51.52 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  44.44 
 
 
133 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  45.45 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  49.59 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  47.73 
 
 
149 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  56.25 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  46.34 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  47.54 
 
 
167 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  51.49 
 
 
147 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  49.5 
 
 
145 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  51.49 
 
 
147 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  51.49 
 
 
147 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  48.85 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  52.43 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  45.97 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.15 
 
 
333 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  43.41 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  39.85 
 
 
159 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  49 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  36.64 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  45.36 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  44.14 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.12 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.04 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  37.9 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.91 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  38.94 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  41.73 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  45.16 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.53 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.58 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.81 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.02 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  41.27 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  41.27 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  43.08 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  43.08 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  45.3 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  39.2 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.82 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  44.55 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  42.16 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  42.62 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  38.78 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  46.36 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  35.11 
 
 
335 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  41.54 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  36.04 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.69 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.69 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  42.11 
 
 
178 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  39.22 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.12 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  38.94 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  35.11 
 
 
336 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  35.11 
 
 
336 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  39.81 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  35.11 
 
 
336 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  35.11 
 
 
336 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.17 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  39.5 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  38.68 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.83 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  34.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  40.74 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40.77 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  37.96 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  37.17 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  37.17 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  37.17 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  37.86 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  37.17 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>