175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1471 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  253  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  55.73 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  46.21 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  46.21 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  46.21 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  49.6 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  51.26 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  46.21 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  52.83 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  45.38 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  43.94 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  50.38 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  47.32 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  50.42 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  48.44 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  50.94 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  50.48 
 
 		 181 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  43.75 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  49.6 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  48.48 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  40.83 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  46.15 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  40.62 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  46.62 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  45.86 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  38.28 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  48.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.46 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  45.87 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  47.47 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  47.47 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  47.47 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  39.66 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.57 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  47.42 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.76 
 
 		 333 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  43.9 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.86 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.03 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.11 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.8 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  44.74 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  42.98 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  42.98 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40.68 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  40.54 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  40.32 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  36.3 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.09 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  36.22 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  40.5 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  41.38 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  28.79 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.3 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  41.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.07 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  34.85 
 
 		 335 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.6 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.6 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  38.32 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.18 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.06 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  40.15 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  37.04 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  38.85 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  38.4 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  45.78 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  45.78 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  44.35 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  38.79 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  34.75 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>