149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1276 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  46.46 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  46.46 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  52.88 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  40.8 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  53.54 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  42.98 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  42.98 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  42.98 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  42.22 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  45.31 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  41.73 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  47.57 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  43.9 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  44.86 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  42.61 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  51.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  51.69 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  45.87 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  49.37 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  44.55 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  39 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.52 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  38.1 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  43.69 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  36.84 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  37.74 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.78 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  40.91 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.61 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.46 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0942  hypothetical protein  28.74 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000599869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  34.29 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.02 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.1 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  32.76 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  38.55 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  36.89 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  37.7 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  32.8 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  33.07 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  32.79 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.4 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  33.91 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.75 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.75 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  32.48 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  39.42 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  38.83 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  30.97 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  37.86 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  39.42 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2963  hypothetical protein  28.83 
 
 		 230 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.40787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  34.35 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  41.07 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  41.07 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  36.79 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  32.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.54 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.16 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.8 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  33.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.64 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  31.37 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>