224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5688 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  290  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  80.14 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  80.14 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  68.7 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  54.42 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  55.4 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  58.16 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  58.39 
 
 		 145 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  67.57 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  71.84 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  62.16 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  61.36 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  46.15 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.16 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  47.33 
 
 		 181 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  46.97 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  46.21 
 
 		 144 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  43.85 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  45.45 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  45.45 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  41.54 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  43.75 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  38.64 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  44.44 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.88 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  41.41 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  44.07 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  44.7 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  42.52 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  45.45 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  44.7 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40.15 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  49.53 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  42.11 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  44.78 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  42.2 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  55.14 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  47.45 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  38.33 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  40.46 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  41.22 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  46.88 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  46.36 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  43.51 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  38.35 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  36.15 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.82 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.82 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  45.69 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  37.98 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  41.18 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  41.03 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  43.31 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  45.56 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.35 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  44.14 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  45.56 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  45.56 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  41.82 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.45 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  37.32 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.03 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  41.18 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  34.35 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.5 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  37.88 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  38.33 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  37.88 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  39.31 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  35.07 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  35.07 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  39.55 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  43.02 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  40.91 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  44.62 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  34.59 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.69 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.82 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  36.67 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  38.03 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.19 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>