80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1122 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  322  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  72.96 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  50.7 
 
 		 179 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  43.38 
 
 		 178 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  36.88 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.67 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  38.06 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  47.75 
 
 		 207 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  38.75 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.2 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.36 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  39.87 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  35.37 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  45.11 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  30.57 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  39.34 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  41.07 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  39.87 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  42.71 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40.52 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  38.75 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  38.24 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  29.37 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  31.39 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  36.72 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  32.54 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  38.6 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.07 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  39.83 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  30.15 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.06 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.82 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  32.28 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  36.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  30.17 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  35.17 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  39.39 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  37.93 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  32.41 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  34.48 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  41.05 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  31.4 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  27.37 
 
 		 138 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.43 
 
 		 163 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  36.19 
 
 		 133 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  34.31 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.66 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  31.62 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  30.65 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.09 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  34.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  30.28 
 
 		 125 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  34.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.63 
 
 		 159 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  34.34 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>