166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3856 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  48.65 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  46.85 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  56.07 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.95 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40.5 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  46.49 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  53.64 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  53.64 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.16 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  49.09 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  38.26 
 
 		 170 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  34.48 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  51.35 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  39.57 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  45.59 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  41.03 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  36.15 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  38.58 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  41.12 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  39.04 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  38.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.31 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  38.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.16 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  36.94 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  36.94 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40.95 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.7 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  39.39 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  39.23 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.64 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  35.51 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.45 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.04 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  35.46 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  37.04 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  45.54 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.88 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  44.95 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.82 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  36 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  37.27 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  41.12 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35.4 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  34.01 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  41.58 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  34.58 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.28 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  37.96 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  41.05 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.89 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  38.05 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  35.85 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  39.62 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  40.24 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  36.45 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  38.32 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  37.17 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.85 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  36.67 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  34.4 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  35.45 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  36.08 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  39.56 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  38.38 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  36.64 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  37.04 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.61 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.11 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  34.86 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  38.16 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>