107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4258 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  83.93 
 
 		 168 aa  286  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  74.4 
 
 		 165 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  60.84 
 
 		 178 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  60.12 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  57.53 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  57.05 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  54.04 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  57.06 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  67.67 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  40.14 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  42.14 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  41.3 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  37.23 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  39.87 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  36.17 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.32 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  40.94 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  38.13 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  37.4 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.21 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  31.16 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  39.58 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  42.65 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  40.18 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  41.73 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  39.29 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  44.79 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.77 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.06 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  38.6 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.35 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  32.86 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  36.57 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.93 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.95 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  32.85 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.07 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  34.44 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  32.62 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  34.82 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  29.29 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  27.97 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.3 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  34.35 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  39.26 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  33.07 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  33.65 
 
 		 133 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  30.91 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  32.17 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.81 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  31.86 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.77 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  29.41 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  32.87 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  32.87 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.06 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.06 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  34.78 
 
 		 336 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  35.04 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  32.32 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  33.7 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  33.7 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  33.7 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  33.7 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.09 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  24.8 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  30.84 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  34.86 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  28.24 
 
 		 159 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  37.33 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>