91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3127 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  43.61 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  44.06 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  41.13 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  41.84 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  39.86 
 
 		 163 aa  95.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  40.94 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  41.61 
 
 		 196 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  38.18 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  39.44 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  42.04 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  34.75 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  35.17 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  37.18 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  35.82 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  35.84 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.97 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  42.14 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  38.52 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  34.51 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  38.51 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  27.89 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  36.91 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  39.2 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  36.3 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  42.96 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  32.61 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.08 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  35.33 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  40.88 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  31.01 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  34.06 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  36.84 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  38.3 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  36.76 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  33.1 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  34.29 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.01 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.96 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  39.18 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  30.52 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  28.78 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  29.08 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  30.47 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.46 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  29.13 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.31 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  27.56 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  29.23 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  32.06 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  30.37 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  38.95 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  32.26 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  28.99 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.97 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  31.53 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  32.91 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  24.44 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  35.76 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  33.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  32.74 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  32.59 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  32.43 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.26 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  29.47 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  28.69 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  26.72 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.1 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.9 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>