76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1731 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  49.4 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  44.58 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  49.32 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  41.01 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  38.81 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  37.06 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  38.56 
 
 		 178 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  36.5 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  36.08 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.15 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.97 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  32.28 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  36.14 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  37.97 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  31.06 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  34.5 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  33.94 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  34.32 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  38.97 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  33.08 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  34.35 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  32.09 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.54 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  31.71 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  33.06 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  36.03 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.03 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.76 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  31.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  30.57 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  35.62 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.82 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  30.28 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  31.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  27.41 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  30.17 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  34.81 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  30.17 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  30.15 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  32.46 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  29.66 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.29 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.62 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.62 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.48 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  37.23 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  29.77 
 
 		 142 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.06 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  34.48 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  33.91 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  29.77 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  33.63 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  27.43 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  32.74 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  31.29 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>