81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2095 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  74.29 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  75 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  66.67 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  64.54 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  63.83 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  63.83 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  55.32 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  57.86 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  57.25 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  60.99 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  63.12 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  53.9 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  52.14 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  53.57 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  52.14 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  52.14 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  52.86 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  53.66 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  53.66 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  51.77 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  51.45 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  45.71 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  47.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  49.6 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  43.38 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  50.72 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  50.46 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  44.8 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.48 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  41.3 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.78 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.06 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.06 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.96 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.77 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.85 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  38.39 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  36.84 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.6 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  34.82 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.09 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.6 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.86 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  37.38 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  29.85 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.23 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  30.15 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.26 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  31.73 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  32.76 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  33.82 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.72 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  30.82 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.8 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.32 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  28.36 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  31.94 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  30.37 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.83 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  34.91 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  29.36 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  31.71 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>