101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0487 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  370  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  85.89 
 
 
189 aa  254  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  54.03 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  42.19 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  39.23 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  44.26 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  47.58 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  39.29 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  46.28 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  48.11 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  41.75 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  36.81 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  43.31 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  32.39 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  35.46 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  40.38 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  39.23 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  31.69 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  39.33 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  43.33 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  39.29 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  42.34 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  43.43 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.04 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  38.6 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  39.42 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  40.38 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  42 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  42.45 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  32.09 
 
 
168 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  40.74 
 
 
174 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  43.9 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 
125 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  40.34 
 
 
160 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  31.09 
 
 
163 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  39.56 
 
 
121 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  43.81 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  36.69 
 
 
174 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  36.45 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  37.37 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  40.74 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.51 
 
 
145 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  34.59 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.88 
 
 
143 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  36.92 
 
 
164 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  34.62 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.05 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.2 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  30.83 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.17 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.95 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  34.55 
 
 
138 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  35 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.17 
 
 
139 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  28.23 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  38.39 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  38.32 
 
 
150 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  38.32 
 
 
150 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.48 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  46.23 
 
 
166 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  34.91 
 
 
170 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.01 
 
 
137 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.77 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  35.85 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  35.85 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  32.71 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  33.77 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  39.53 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  34.62 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  29.41 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.15 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  37.21 
 
 
133 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  35.48 
 
 
135 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  35.24 
 
 
134 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  37.78 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  40 
 
 
137 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  36.54 
 
 
132 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  38.2 
 
 
164 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  35.14 
 
 
121 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  29.1 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  35.44 
 
 
132 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.86 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>