60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1201 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  350  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  49.09 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  50.7 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  41.25 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  40.83 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  38.99 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  41.79 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  39.34 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  40.99 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  40.65 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  36.43 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  38.06 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  45.45 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  35.4 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  41.72 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  37.78 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  35.9 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  45.45 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  32.37 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  36.07 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  42.15 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  26.71 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  40.71 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  35.29 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  35.06 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  33.78 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  30.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  28.78 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  37.25 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.58 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.06 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  35.26 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  29.58 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  27.07 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  28.68 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.91 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  31.86 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  41.84 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  31.15 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  31.62 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  31.62 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  32.17 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  31.3 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  32.85 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.14 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>