132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2495 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  57.89 
 
 
168 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  56.6 
 
 
165 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  50.34 
 
 
167 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  52.11 
 
 
178 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  57.05 
 
 
168 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  53.46 
 
 
168 aa  147  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  51.03 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  45.18 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 
168 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  40.44 
 
 
165 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  51.95 
 
 
166 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  42.22 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  39.62 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  37.32 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  41.01 
 
 
165 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  41.3 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  37.18 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.8 
 
 
181 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  37.97 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  39.2 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  35.09 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  29.19 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.13 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  33.81 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.8 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  41.82 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  30.54 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  38.82 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  29.63 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.11 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  37.39 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  39.1 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.66 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.74 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  36.5 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  36.73 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  39.68 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  35.96 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  39.36 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  34.78 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.28 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.04 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.93 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  30.67 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.82 
 
 
139 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  35.34 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  31.9 
 
 
172 aa  54.7  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  33.05 
 
 
135 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  34.71 
 
 
125 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  41.59 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.95 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  37.59 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  31.86 
 
 
141 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  32.38 
 
 
178 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  35.14 
 
 
150 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  35.14 
 
 
150 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  34.35 
 
 
149 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.96 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.46 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.19 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  36.04 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  28.68 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  32.69 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  39.24 
 
 
143 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  39.29 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  37.29 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  33.04 
 
 
144 aa  47.8  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  31.3 
 
 
136 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  34.91 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  43.59 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  34.94 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.06 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.97 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  35.4 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  29.27 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  31.85 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  35.82 
 
 
149 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  27.01 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>