120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0990 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  53.5 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  54.61 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  55.41 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  50.66 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  50.75 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  49.7 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  58.21 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  56.88 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  43.67 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.97 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  36.97 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  37.68 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  37.09 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  33.73 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  35.83 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.24 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  36.17 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  33.1 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  43.24 
 
 		 197 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  36.18 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  32.37 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  37.6 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  29.52 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  43.27 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  28.65 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  41.61 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  36.8 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  35.37 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  34.55 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  30.88 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  39.23 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  39.82 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.14 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  28.03 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.75 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  28.65 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.04 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  34.82 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40.78 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  38.18 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  30.66 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  39.74 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.03 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  30.25 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  30.66 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  36.03 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  34.82 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  33.91 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  32.91 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  33.59 
 
 		 336 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  35.54 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  28.89 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  38.37 
 
 		 336 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  31.48 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  35.4 
 
 		 336 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  33.59 
 
 		 336 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  38.37 
 
 		 336 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  29.57 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  38.39 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  39.81 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  28.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  34.59 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.59 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  33.88 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  40.37 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  27.86 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  40.37 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  32.71 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  33.94 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  30.77 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  33.01 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>