103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4374 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  83.93 
 
 		 168 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  78.48 
 
 		 165 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  58.74 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  58.78 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  54.79 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  57.89 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  57.43 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  60.84 
 
 		 170 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  66.17 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  38.75 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  41.13 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  39.88 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  38.69 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  41.88 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  35.76 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  36.17 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  37.96 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  42.52 
 
 		 167 aa  90.9  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  37.06 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  38.82 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  36.17 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  37.06 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  35.56 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  36.59 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  31.61 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.69 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  41.73 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  39.74 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  37.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.93 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.46 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  41.96 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.57 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  41.23 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  34.81 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  42.34 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  34.38 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.44 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  34.25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  35.97 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.87 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.28 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.23 
 
 		 121 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.07 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.19 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  32.37 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  32.37 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.39 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.14 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.85 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  36.51 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  35.05 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.93 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.12 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  41.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.37 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  31.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  31.16 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  32.32 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  39.31 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  31.09 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  36.3 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  31.86 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  34.23 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  31.94 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  33.56 
 
 		 144 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  36.78 
 
 		 336 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 141 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  34.51 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  26.4 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  39.19 
 
 		 335 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  30.88 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  35.63 
 
 		 336 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  35.63 
 
 		 336 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>