39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4732 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  51.97 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  45.65 
 
 
180 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  41.84 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  34.04 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  36.17 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  35.25 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  34.81 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  27.91 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  37.61 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  30.99 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  36.67 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.8 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  35.81 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  32.39 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  38.37 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  30.46 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  36.75 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  38.18 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  32.12 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  35.21 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  35.77 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  31.41 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  31.16 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.59 
 
 
165 aa  61.2  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  32.8 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  38.18 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  43.66 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  32.9 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  30.17 
 
 
207 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  35.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  34.96 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  35.25 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  27.82 
 
 
147 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  29.23 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>