134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2147 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  353  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  50.35 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  47.14 
 
 
160 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  48.87 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  46.88 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  41.73 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  44.23 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  41.61 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  38.3 
 
 
165 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.59 
 
 
165 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 
165 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  43.61 
 
 
178 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  38.97 
 
 
165 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  42.61 
 
 
168 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  36.88 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  35.38 
 
 
157 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  38.52 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  47.33 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  42.02 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  36.23 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  45.92 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  37.41 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.34 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  44.2 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  41.73 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  42.73 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.37 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  34.9 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.87 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.37 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  35.97 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  47.01 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.05 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  40.78 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  33.03 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.39 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  39.64 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  41.73 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  36.96 
 
 
160 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  39.22 
 
 
143 aa  61.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  37.76 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.11 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.75 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  29.55 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.73 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  38.74 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  38.74 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  37.39 
 
 
149 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  31.5 
 
 
139 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  37.62 
 
 
133 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  44.44 
 
 
145 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  31.06 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  31.06 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.06 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  29.51 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  30 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.63 
 
 
145 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  36.61 
 
 
121 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  29.23 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  35.64 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  30.09 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  33.61 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  28 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.81 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  32.17 
 
 
133 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  32.91 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  31.45 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  29.77 
 
 
134 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  31.72 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  44.29 
 
 
166 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  30.15 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  28.07 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  34.45 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  34.02 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  29.23 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.4 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  29.01 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 
135 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  31.97 
 
 
135 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  25.84 
 
 
138 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  29.7 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.06 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  30.47 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>