181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3355 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  71.79 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  57.64 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  68.1 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  68.1 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  62.61 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  55.41 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  60.56 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  64.35 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  65.93 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  59.48 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  62.39 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  42.54 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.67 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  39.55 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.72 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.78 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  43.07 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  43.07 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  43.07 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  40.65 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  42.65 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  47.75 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  46 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  39.1 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  43.59 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  39.69 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  35.77 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  39.55 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.57 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.52 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  36.69 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  42.2 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  38.71 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  33.83 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  40.74 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.41 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  38.85 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  42.11 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  39.83 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  40.19 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  40.14 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.62 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  36.89 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  38.97 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.85 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  38.41 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  37.93 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  39.23 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  36.17 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.71 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  32.12 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  35.77 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.39 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.97 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  38.06 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  32.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  43.86 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.86 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  40.7 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  35.05 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  36.17 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  31.88 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  34.03 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  34.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.94 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  40.22 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  42 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  42 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  33.06 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  42 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  37.89 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  37.89 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  40.22 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>