177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0219 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  65.52 
 
 
151 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  58.99 
 
 
149 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  63.04 
 
 
145 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  71.68 
 
 
149 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  69.64 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  58.57 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  54.07 
 
 
147 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  69.37 
 
 
150 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  69.37 
 
 
150 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  60.99 
 
 
164 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  58.87 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  47.33 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.29 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  43.7 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  44.54 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  41.04 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  42.45 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  36.57 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  40.16 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  42.34 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  38.02 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  42.24 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  38.02 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  39.17 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  38.81 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  55.14 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  46.85 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  39.2 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  41.61 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  41.46 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  41.22 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.88 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  44.79 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  41.9 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  37.01 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  39.37 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.17 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  43.4 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  40.3 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  41.32 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.31 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.94 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  37.06 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  40.88 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  37.69 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  34.81 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  41.53 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  38.74 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.19 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  41.51 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.82 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  35 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  32.85 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.61 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.59 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.34 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.59 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.59 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  41.74 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  46.36 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  38.24 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  32.35 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.15 
 
 
333 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  35.61 
 
 
335 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  39.66 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  37.41 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.08 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  38.97 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  38.97 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  37.61 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.16 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  36.51 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.39 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  36.89 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  37.7 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  34.45 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  39.67 
 
 
336 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  38.84 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  38.84 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  38.84 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  39.67 
 
 
336 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  41.3 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  38.68 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>