109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1736 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 		 157 aa  319  8e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  44.8 
 
 		 336 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  44.8 
 
 		 336 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  44.8 
 
 		 336 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  44.8 
 
 		 336 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  43.09 
 
 		 335 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  44.8 
 
 		 336 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  39.32 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.1 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  42.74 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  32.35 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  33.77 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  39.2 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  40.5 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  35.34 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  38.4 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  31.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  39.05 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  39.25 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  38.53 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  36.8 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.4 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.28 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  26.98 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  36.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  36.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.48 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  27.19 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  30.21 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  32.54 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  30.85 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  31.52 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  28.87 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  36.45 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  31 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  26.45 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  28.85 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  29.6 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  31.4 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  32.38 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  32.41 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.18 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  31.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.04 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.75 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  30.95 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  24.81 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.94 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.93 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.93 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  29.82 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  31.97 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  27.64 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  26.83 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  31.48 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  35.56 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  30.89 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  29.84 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.26 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  29.73 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  32.69 
 
 		 164 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  30.56 
 
 		 166 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  26.4 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  26.83 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  36.59 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  37.1 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  28.36 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>