168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0913 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  59.54 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  51.52 
 
 		 139 aa  137  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  49.62 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  44.62 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  48.44 
 
 		 335 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  41.8 
 
 		 133 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  38.31 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 132 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  53.21 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  53.21 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  48.76 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  44.26 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  44.26 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  43.44 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  40.15 
 
 		 143 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  44.27 
 
 		 144 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  44.03 
 
 		 336 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  44.03 
 
 		 336 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  44.03 
 
 		 336 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  44.78 
 
 		 336 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.56 
 
 		 333 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  44.09 
 
 		 336 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  44.17 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.63 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  46.94 
 
 		 132 aa  89  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  40.71 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  42.19 
 
 		 133 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  44.74 
 
 		 135 aa  87.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  49.49 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  43.9 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  46.23 
 
 		 144 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  46.83 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  45.11 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  48.08 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  40.16 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  42.28 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  31.21 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  44.04 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  43.09 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  41.84 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40.16 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  41.94 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.37 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  41.24 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  39.84 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  39.84 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  39.29 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.26 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  36 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  38.4 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  41.9 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  38.21 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  37.4 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  39 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  38 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  34.17 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  37.19 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  37.9 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  42.57 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  37.17 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  40.22 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  35.94 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  44 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  44 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  37.63 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  28.69 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  42.68 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>