180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4361 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  52.73 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  44.19 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  45.31 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  49.6 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  43.08 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  43.08 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  41.54 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  46.09 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  38.93 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  41.86 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  45.08 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  44.92 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  42.64 
 
 		 181 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  42.72 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.98 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.97 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  39.42 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  41.3 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.71 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  40.62 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  39.45 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.2 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.23 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.64 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.39 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.77 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  35.16 
 
 		 335 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  35.88 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.69 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3443  hypothetical protein  28.97 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.6 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  34.65 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  37.01 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  34.38 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  39.6 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  39.6 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  41.28 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.27 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  35.24 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  38.05 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  38.05 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  35.66 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.36 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  37.89 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.37 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  28.44 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  31.3 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35.24 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  30.83 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.74 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  36.27 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  34.88 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  33.6 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  36.89 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  31.43 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.62 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  28.03 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>