58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5342 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  273  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  90.97 
 
 		 144 aa  234  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  76.55 
 
 		 145 aa  206  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  72.41 
 
 		 157 aa  199  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  73.79 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  72.41 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  62.24 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  60.99 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  62.24 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  62.24 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  61.81 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  54.86 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  55.4 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  53.1 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  53.17 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  53.17 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  50.34 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  50.69 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  50.69 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  48.92 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  48.92 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  50.37 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  48.92 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  45.83 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  51.97 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  45.71 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  49.6 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  53.7 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  41.78 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.01 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  29.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  29.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.23 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  31.11 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  28.89 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  24.6 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.23 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  29.73 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  31.53 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  28.15 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  35.58 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  26.72 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  33.65 
 
 		 160 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  31.78 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  25.56 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  26.5 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>