73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0578 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  58.04 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  50.46 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  48.6 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  55.05 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  55.05 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  55.05 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  44.04 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  44.04 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  50.45 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  51.06 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  51.06 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  50.46 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  46.3 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  46.73 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  46.73 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  46.73 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  45.79 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  49.07 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  53.7 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  45.71 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  53.15 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  44.86 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  52.78 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  47.92 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  44.86 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  49.47 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  37.38 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  53.7 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  40.91 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  37.38 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.91 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.91 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.74 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.79 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  36.79 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  34.91 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.41 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.74 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.65 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.65 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  30.48 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  30.84 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  36.45 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  29.25 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.74 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  30.28 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  30.19 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  30.39 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  32.29 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  25.51 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.48 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.04 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  41.51 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35.51 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  28.81 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>