102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0513 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  288  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  58.99 
 
 
143 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  61.59 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  54.35 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  49.64 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  49.64 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  54.01 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  53.66 
 
 
143 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  53.66 
 
 
143 aa  123  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  48.89 
 
 
144 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  46.81 
 
 
142 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  54.81 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  52.21 
 
 
144 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  49.63 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  48.57 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  49.26 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  46.48 
 
 
144 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  50.74 
 
 
157 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  47.79 
 
 
146 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  50 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  46.85 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  47.41 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  47.15 
 
 
142 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  46.72 
 
 
142 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  43.38 
 
 
146 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  49.3 
 
 
153 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  52.21 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  40.88 
 
 
141 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  49.64 
 
 
143 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  40.58 
 
 
141 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  46.79 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.35 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  32.35 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  41.23 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  41.96 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  41.07 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  41.07 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  41.07 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.88 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  38.05 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  28.03 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.21 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  27.42 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  40.18 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  32.73 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  38.39 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  42.06 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  37.14 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  39.53 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  37.84 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  28.36 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.83 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.25 
 
 
135 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  38.05 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  26.79 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  38.39 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  32 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  31.62 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  30.5 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  31.48 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  27.82 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  29.37 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  29.7 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  32.58 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  40.37 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  34.06 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  34.06 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  37.37 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  30.99 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  37.86 
 
 
135 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  30.08 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  35.78 
 
 
134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  35.2 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  35.2 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  34.62 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  31.03 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.37 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  31.78 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  35.51 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.37 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  35.78 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  35.78 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>