60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6094 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 144 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  90.97 
 
 		 144 aa  253  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  79.31 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  75.86 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  75.86 
 
 		 145 aa  207  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  76.55 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  62.94 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  63.12 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  61.54 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  63.89 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  60.84 
 
 		 143 aa  147  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  54.86 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  56.12 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  53.1 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  52.08 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  53.17 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  52.08 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  53.17 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  51.39 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  51.39 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  48.61 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  50.36 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  48.61 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  46.9 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  48.57 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  51.97 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  48.55 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  46.53 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  49.6 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  41.78 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  53.7 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  30.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  29.63 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  31.11 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  31.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.06 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  30.63 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.23 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.35 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  29.41 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  32.71 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  27.41 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  39.76 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  30.88 
 
 		 167 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  26.72 
 
 		 147 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  31.54 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  31.4 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  31.34 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>