113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3227 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  48.94 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  43.36 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  42.14 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  44.06 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  44.06 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  44.06 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  42.25 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  45.67 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  42.55 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  42.55 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  41.78 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  42.55 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  41.84 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  41.96 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  40.56 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  41.55 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  42.19 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  42.19 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  39.44 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  39.44 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  44.06 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  43.48 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  41.78 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  42.06 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  42.14 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  37.17 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  37.21 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.57 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.84 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  30.17 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  35.09 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.33 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  35.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  37.17 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  29.79 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  29.23 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.59 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  29.79 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  30.97 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  39.6 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  30.56 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  32.46 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.72 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.18 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  38.61 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  29.09 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  40.19 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  27.52 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.99 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.58 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.62 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  34.19 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  28.44 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  30.63 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  25.78 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  24.63 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  33.96 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  34.65 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  34.65 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  28.97 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  29.08 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  31.09 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  31.15 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>