64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3823 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  80.42 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  75 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  63.89 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  64.58 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  64.58 
 
 		 157 aa  170  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  64.58 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  61.81 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  60.56 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  56.64 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  63.89 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  56.12 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  53.85 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  56 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  56 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  51.05 
 
 		 146 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  53.15 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  50.35 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  50.35 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  50.35 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  50.35 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  46.85 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  46.85 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  48.44 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  43.88 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  51.8 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  44.53 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  47.2 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  44.06 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  36.03 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  34.07 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  32.09 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.83 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.01 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  34.19 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.55 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.82 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.21 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.43 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.77 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.55 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  32.28 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  26.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  29.93 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  25 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  33.58 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  28.78 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  25.95 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  34.53 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  34.53 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  37.35 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>