137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1228 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 140 aa  273  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  66.15 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  51.08 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  50.72 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  49.64 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  49.64 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  52.46 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  52.46 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  50.36 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  53.33 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  49.29 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  55.8 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  51.8 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  49.28 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  48.2 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  47.86 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  49.64 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  46.81 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  46.81 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  52.46 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  51.8 
 
 		 143 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  52.78 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  53.24 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  42.14 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  40.74 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  46.34 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  42.14 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  36.3 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.23 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.34 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  33.82 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  32.79 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  34.56 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.33 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  27.48 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  29.77 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.56 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.94 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  30.58 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.04 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.1 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  33.91 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.91 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  36.7 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.26 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  32.73 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  35.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  35.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.31 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  31.82 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.31 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  35.92 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  30.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  36.84 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.34 
 
 		 333 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.11 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  33 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>