141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0603 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  94.07 
 
 		 135 aa  239  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  71.43 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  67.67 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  68.42 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  63.91 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  63.16 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  63.16 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  63.16 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  61.48 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  60.15 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  60.9 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  60.9 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  56.92 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  59.84 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  59.84 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  53.38 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  53.38 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  53.38 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  54.89 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  58.65 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  53.38 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  59.4 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  56.72 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  59.4 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  54.14 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  54.89 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  55.81 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  60.15 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  58.33 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  54.62 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  60.15 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  54.1 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  53.28 
 
 		 132 aa  136  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  53.38 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  57.36 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  58.46 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  54.92 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  50.82 
 
 		 133 aa  129  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  55.74 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  55.04 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  53.28 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  50.47 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  46.6 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  41.22 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  43.2 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  40.3 
 
 		 164 aa  84.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  35.48 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.06 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  37.9 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  34.58 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.01 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.89 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.59 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.57 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  30.6 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.13 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  33.82 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  33.58 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.13 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  29.77 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  33.61 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  33.83 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  36.46 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  33.6 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.94 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  29.2 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  32.85 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  29.36 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.31 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  29.55 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  33.98 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>