124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3414 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  279  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  48.53 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  47.79 
 
 
143 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  52.14 
 
 
157 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  52.14 
 
 
145 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  50.74 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  47.45 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  51.43 
 
 
145 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  47.06 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  47.79 
 
 
144 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  48.57 
 
 
143 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  46.67 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  46.67 
 
 
146 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  47.06 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  50.41 
 
 
143 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  50.41 
 
 
143 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  53.33 
 
 
153 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  47.41 
 
 
142 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  47.89 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  48.92 
 
 
144 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  44.85 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  47.06 
 
 
141 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  47.79 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  41.84 
 
 
146 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  42.75 
 
 
142 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  45.32 
 
 
144 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  50.36 
 
 
144 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  46.67 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  45.24 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  45.52 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  42.75 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  44.86 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  42.4 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.81 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.23 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.86 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  39.84 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  35.51 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  36.3 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.03 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  35.16 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.5 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  36.84 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 
135 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30 
 
 
132 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  38.74 
 
 
144 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.56 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  33.02 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  38.94 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.61 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  39.58 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  33.05 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.96 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  31.94 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  29.77 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.61 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  27.48 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.88 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.43 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  30.88 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  34.11 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  34.11 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  36.61 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  34.11 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  34.48 
 
 
135 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  34.31 
 
 
135 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  37.04 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.21 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  27.69 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  28.79 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  34.51 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  34.62 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  34.23 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  32.73 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  35.9 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  32.85 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  35.88 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  32.76 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  33.09 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  32.41 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  30.28 
 
 
183 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  32.84 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  33.62 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  34.55 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.59 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  33.03 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  34.23 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  36.04 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  34.78 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>