101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1599 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  277  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  78.77 
 
 		 146 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  78.08 
 
 		 146 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  77.4 
 
 		 146 aa  219  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  76.03 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  70.63 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  65.03 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  64.34 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  52.9 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  48.95 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  47.55 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  49.65 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  47.55 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  46.85 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  48.95 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  48.95 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  47.22 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  47.22 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  46.83 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  48.57 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  47.92 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  46.85 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  44.6 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  41.84 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  48.57 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  43.2 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  45.71 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  46.53 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  41.96 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  40.58 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  42.14 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  36.59 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  41.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  44.21 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.85 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  36.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.13 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  33.85 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  41.23 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  34.72 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  39.82 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  39.82 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.75 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  34.45 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.59 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  39.68 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  36.27 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  39.09 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.82 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  30.91 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  38.6 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  31.9 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.8 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  31.58 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  35.58 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  32.73 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0973  hypothetical protein  30.3 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0109985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.19 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  36.54 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  34.95 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  40.2 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.62 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  32.8 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  36.76 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  35.78 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.92 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.23 
 
 		 165 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  40.4 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  31.88 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.82 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  31.9 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  35.14 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  35.14 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  35.4 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  34.26 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40.95 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  34.26 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>