86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0157 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  62.86 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  43.88 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  45.77 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  40.29 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  43.17 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  41.48 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  41.01 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  40.29 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  40.29 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  42.55 
 
 		 144 aa  97.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  41.73 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  42.03 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  39.52 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  43.7 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  38.76 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  41.3 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  40.58 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  41.01 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  41.73 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  36.96 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  36.3 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  35.45 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.21 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.75 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.09 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.09 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.09 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  31.45 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  32.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  31.85 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.08 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  29.93 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  27.82 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  34.78 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.84 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  35.38 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  30.83 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  26.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  28.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  35.14 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  33.67 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  30.63 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  31 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  34.96 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.26 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.95 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  29.32 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  29.2 
 
 		 160 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  24.22 
 
 		 138 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  35.56 
 
 		 141 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  30.63 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  30.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  30.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  29.77 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  30.17 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  30.25 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  34.23 
 
 		 135 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>